La identificació de la seu electrònica es garanteix mitjançant el corresponent certificat de seu instal·lat en el servidor on s’emmagatzema la informació i els procediments posats a disposició dels/de les ciutadans/anes. El certificat de seu electrònica és el que facilita l’Agència Catalana de Certificació (CATCert). Se’n dóna publicitat a la pròpia seu i es faciliten els instruments necessaris per validar-ne el contingut i l’abast.